首席驅魔師的獨子阿爾受不了父親的苛求而離家，投靠青梅竹馬康納，一起成立靈視偵探社，以解決各種大小雜事維生。
沒󠄊󠄀󠄃有󠄎󠄊󠄀血󠄃󠄎緣󠄵󠄀的󠄀󠄂兄󠄫󠄪弟󠄩󠄎，成󠄕󠄉為󠄊󠄺彼󠄔󠄤此󠄴󠄹的󠄶󠄄精󠄞󠄮神󠄓󠄰支󠄪󠄛柱󠄔󠄷，一󠄽󠄺路󠄟󠄚走󠄕󠄂來󠄞󠄟互󠄽󠄼相󠄯󠄗扶󠄞󠄴持󠄹󠄲。阿󠄃󠄯爾󠄪󠄘自󠄦󠄭小󠄎󠄻成󠄈󠄴長󠄍󠄮於󠄣󠄝高󠄱󠄆壓󠄷󠄄環󠄜󠄞境󠄅󠄔，性󠄸󠄒情󠄛󠄱冷󠄈󠄃漠󠄗󠄢得󠄠󠄔像󠄇󠄅父󠄌󠄓親󠄸󠄈的󠄏󠄟扯󠄉󠄋線󠄚󠄗人󠄄󠄼偶󠄵󠄮，缺󠄒󠄡乏󠄥󠄩待󠄊󠄨人󠄷󠄘接󠄄󠄝物󠄒󠄬的󠄩󠄈常󠄧󠄶識󠄎󠄣，在󠄶󠄓人󠄡󠄝際󠄦󠄁關󠄺󠄣係󠄷󠄆上󠄐󠄾就󠄐󠄹像󠄸󠄯學󠄞󠄚步󠄋󠄃嬰󠄜󠄦孩󠄂󠄩般󠄩󠄺笨󠄩󠄍拙󠄈󠄙。在󠄞󠄛康󠄭󠄈納󠄈󠄟的󠄐󠄻耐󠄅󠄬心󠄲󠄡關󠄇󠄑懷󠄣󠄯下󠄟󠄏，漸󠄠󠄲漸󠄺󠄝有󠄙󠄶了󠄣󠄟人󠄗󠄉該󠄭󠄺有󠄣󠄊的󠄩󠄃情󠄆󠄰感󠄗󠄬。
康納是阿爾唯一放在心上的人。
某天，老顧客藏書人發來一份巨額委託，要求他們前往空靈島回收魔女之書，即被稱為願望魔女、在魔女獵殺中存活至最後的魔女凱瑟琳的日記。她的靈魂被撕成黑白兩半，封印在魔女之書中，此書可以開啟召喚魔女的「魔女遊戲」，召喚魔女者能實現任何願望。
康納被「願望」二字所吸引，但阿爾基於任務危險度一口拒絕。在逼問之下，原來藏書人看上的是康納他所持的異能——「靈力共鳴」，即透過把外在的靈力與自身的靈力交互作用，達到力量的增幅，甚至能令靈體實體化。要回收散落島上的魔女之書因受損而虛化的缺頁，是必不可缺的能力。
康納對實現願望一事耿耿於懷，當晚出外打工時突然失蹤。翌日，阿爾收到裝著斷掌的盒子，藏書人告知康納已淪為魔女遊戲的祭品，被肢解的軀體存放於盒子內作為賭注，阿爾亦強制成為儀式的參與者。
為了救回摯友，阿爾獨自前往空靈島，僱了水鬼船夫吉姆當嚮導，陽光老實人擔起了引路人的責任，而對主人過份執著，像個長不大小孩的噬魂獅涅墨亞，也以腳踏高跟靴子、黑皮衣的搖滾系潮男化形擅自跟來，組成了三人探索小組。
一登島，他們便為島上異常密集的靈體數量而蹩眉。在踏入森林的一刻更遇上裝成迷路小女孩的刺客妮安突襲，阿爾反殺刺客時，康納的幻影竟現身勸阻。一行人在分神時，隨即被同夥的幻境師狄克丟進以空靈島為基礎的巨大幻境裡。
藏書人捎來情報，盒子共有八個，三組參加者各有角色，阿爾為略奪者，需搶奪守衛者手上七個盒子，再與遊戲的發起者君臨者決戰。
幻境重現了二十年前被滅村前的空靈島，村民的靈魂被禁錮在島上，不斷重複生前的行為。三人在康納的幻影指引下，橫渡沼澤，在森林遇到康納父母的靈魂，知道他被遺忘的身世。原先以為康納只是不幸被捲入事件，但他似乎與空靈島有著密不可分的關係。島上藏著比想像中更深的秘密，隨著深入調查而逐步揭露。
他們在村內看到魔女祝福儀式，得知凱瑟琳出身前空靈島，而此島就是魔女遊戲的原點。一行人赫然發現，祝福儀式的主辦人竟是阿爾的父親阿爾伯特，他像惡魔般吞掉村民的靈魂，一直深藏不露的長相竟跟阿爾一模一樣。
他們順行避過幻境裡的種種危機，原本打算以幻境殺人的幻境師見事敗，動手捏碎幻境。他們逃出之際，康納在阿爾面前現身，展示魔女的印記，證明被認定為受害者的他，其實就是發起遊戲的君臨者。盒子裡的是他的身體，獻給阿爾作為參與遊戲的賭注，而現在的他則是運用異能把靈魂強行實體化的結果。他留下一個盒子，以及一句神秘的話，告訴阿爾並不需要勝出遊戲。
當受害者赫然成了幕後黑手，阿爾因康納令人無法理解的行為而心生動搖。他們來到另一個幻境，藏書人替他們理清思緒。康納的做法乃逆天而行，以靈魂狀態存在的他極為不穩，當務之急是要在康納消散前終止遊戲。著急不已的阿爾想到要以燒書的方式強行結束遊戲，但遭同伴阻止。要解開真相，他們在收集餘下的六個盒子的同時，要找回魔女之書的五張缺頁。
他們在碧波灘上找到缺頁，遇到魔女的碎片白凱瑟琳，她對阿爾的態度猶如重遇故人般親切。他們跟魔女談了條件，協助在海妖與人的一場悲戀中，為向魔女許下願望的主角們解開執念。
白凱瑟琳給阿爾一個盒子，成為了臨時夥伴。他們在藍山洞找到缺頁，在記憶殘片看到，凱瑟琳在魔女狩獵時，曾在逃亡途中遭到另一個酷似阿爾的人追捕，後來共渡患難後相知相惜。此人、阿爾和父親，已有三個擁有相同名字，相同長相的人。
被盒子所強化的海獸襲擊洞穴，阿爾墮海，康納在千鈞一髮間再次現身救援，黑凱瑟琳出現，告知康納的氣息已消失，留給他一個盒子。康納為了救下阿爾用盡了最後的力量，阿爾受了嚴重打擊，一直強撐著身心瀕臨崩潰。涅墨亞在阿爾倒下時，孤身闖進陷阱，替主人尋找餘下的三個盒子，以及三張缺頁。
阿爾在昏迷時，意識被守衛者的祭品朱利安拉進了精神世界，對方不願為了取得新的身體而殺戮。他們達成共識，要以不流血的方式結束遊戲，這點令阿爾想起康納說過「不用勝出遊戲」的話。輸掉也沒關係的賭注，成了解開謎團的關鍵。
阿爾醒來後，救出為了取得盒子而被怨魂吞噬的涅墨亞，同時因分擔使魔一半的傷勢而受了重傷。
盒子尚餘兩個，缺頁則餘三張。他們跌跌撞撞來到地下湖，從缺頁中發現當年的阿爾就是阿爾伯特。阿爾知悉魔女善良的本性，放棄了燒書的念頭，希望她能繼續存在。
另一張缺頁在地下湖出口的螢火之森尋獲。阿爾伯特為了拯救魔女而死，靈魂被魔咒擊中而瀕臨破碎。悲慟不已的她想起小時候曾看過，能起死回生的禁忌之法，於是為了實現自身的願望，她獻祭島上所有人的性命，不顧一切地復活了他，但過程中出了亂子，意外喚醒了被古老法陣封印在島上的魔獸殘魂。阿爾伯特的靈魂被殘魂污染而墜落成魔。
在火山口的最後一張缺頁，揭開了二十年前空靈村滅村的真相。阿爾伯特的肉體歷經百年而逐漸消亡，他二十年前偷來魔女之書，發動魔女遊戲，要求凱瑟琳為他再造新肉體。魔女念及舊情，再次犯下大罪，以空靈村的村民為代價，塑造了新的肉體，並把當初阿爾伯特在復活過程中掉落的靈魂碎片注入身體，成了今天的阿爾。二十年後，阿爾伯特想透過遊戲搶奪阿爾的身體。
為了斬斷孽緣，阿爾與父親進行對決，他因受傷未癒而陷入苦戰，管家華格納及時出現，發動古老法陣，封印了惡魔。原來他的身份是百年前魔女狩獵的隊長，後悔盲信了教會對魔女的指控，毀了兩名年輕人的人生。他為了贖罪，一直跟在阿爾伯特身邊，伺機重新封印惡魔。
為了爭奪最後的盒子，守衛者再次襲來。阿爾一方多是傷員，一輪激戰後，阿爾被拖進幻中境殺死。他犧牲了自己，把康納換了回來，遊戲結果經魔女認可後終止。
魔女黯然離去時，阿爾叫住了她。原來早在當初，狄克已把所有人拖進幻境，雙方合謀欺騙魔女，由阿爾裝死騙過魔女，讓所有參與者都能活下來。
遊戲唯一的犧牲品是康納，他的靈魂似乎已消散，哪裡也尋不著。阿爾抱著好不容易尋回的摯友身體痛哭，向華格納詢問事件的真相。失蹤的前天，華格納聯繫上康納，並把他帶到島上。康納為了救下阿爾，按照計劃搶先發動了魔女遊戲，並把阿爾伯特指定為祭品，阻止了他奪去阿爾的身體。康納的犧牲是為了讓阿爾知悉真相，並為他爭取戰勝命運的機會。
就在萬念俱灰之際，破除束縛趕來的藏書人掏出一個瓶子，原來是他救下了康納快將消逝的靈魂。三個月後，在他的努力下，成功修復了康納的靈魂。
康納在家中醒來，阿爾尋回了摯友。所有人的願望都得以實現，那是魔女遊戲帶來的奇蹟。